Hlavným poslaním katedry je poskytnúť študentom akreditovaných študijných programov všeobecné veterinárske lekárstvo, hygiena potravín, bezpečnosť krmív a potravín a farmácia kvalitné vedomosti z vedných odborov farmakológia a toxikológia na dnešnej úrovni veterinárskej a farmaceutickej vedy, ako aj environmentálnej výchovy a vzdelávania. Výučba študijných programov prebieha v slovenskom jazyku a v programe všeobecného veterinárskeho lekárstva i v anglickom jazyku. Získané teoretické a praktické poznatky budú môcť poslucháči v budúcnosti aplikovať v každodennej veterinárskej a farmaceutickej praxi.
Katedra poskytuje vzdelávanie nielen v oblasti pregraduálnej výchovy, ale aj postgraduálnej výchovy vo forme školiacich kurzov a študijných programov doktorandského štúdia.
Vedeckovýskumná činnosť katedry je zameraná na štúdium účinkov liečiv, pesticídov a iných xenobiotík na organizmus človeka a zvierat, ako aj pomocou alternatívnych in vitro testov.
Katedra farmakológie a toxikológie sa člení na 2 ústavy: Ústav farmakológie a Ústav toxikológie.
Ústav farmakológie
Ústav farmakológie zabezpečuje výučbu povinných predmetov „Farmakológia“ a „Farmácia a terapeutiká“ a povinne voliteľného predmetu „Klinická farmakológia“ v študijných programoch všeobecné veterinárske lekárstvo a hygiena potravín v slovenskom jazyku a predmetov “Pharmacology“ a “Pharmacy and therapeutics“ pre zahraničných študentov v anglickom jazyku. V študijnom programe farmácia zabezpečuje ústav výučbu povinného predmetu “Veterinárna farmakológia“ a povinne voliteľného predmetu “Veterinárne liečivá“.
Od akademického roka 2012/2013 bude prebiehať výučba predmetu “Introduction to pharmacology“ pre zahraničných študentov v anglickom jazyku.
Ústav farmakológie je vo svojej vedeckovýskumnej činnosti zameraný na problematiku farmakológie liečiv, terapeutických prípravkov a ich rezíduí v organizme zvierat. Orientuje sa na riešenie úloh farmaceuticko-farmakologickej a klinickej oblasti.
Ústav toxikológie
Ústav toxikológie zabezpečuje pregraduálnu výučbu povinného predmetu toxikológia v študijných programoch všeobecné veterinárske lekárstvo, hygiena potravín a farmácia v slovenskom jazyku. Povinný predmet toxicology a povinne voliteľný predmet ecotoxicology je vyučovaný u zahraničných študentov v anglickom jazyku. Ústav zabezpečuje aj výučbu povinných predmetov farmaceutická propedeutika v študijnom programe farmácia, analýza kontaminantov v krmivách a potravinách v študijnom programe bezpečnosť potravín a krmív a povinne voliteľného predmetu základy vedeckej práce v študijných programoch všeobecné veterinárske lekárstvo a hygiena potravín a história a dejiny farmácie v študijnom programe farmácia.
Ústav rieši výskumné úlohy týkajúce sa účinku xenobiotík, predovšetkým pesticídov, na organizmus hospodárskych, domácich a voľne žijúcich zvierat, ako aj hodnotenia ich zdravotného a environmentálneho rizika.